Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms