Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms