Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SctQ08535 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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SctQ08535 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SctQ08535 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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SctQ08535 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SctQ08535 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SctQ08535 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SctQ08535 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SctQ08535 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SctQ08535 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms