Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms