Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnb1Q03717 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms