Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pax5Q02650 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms