Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms