Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoa1Q00623 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms