Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.8 ms