Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Otx2P80206 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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