Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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