Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CgnP59242 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CgnP59242 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CgnP59242 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CgnP59242 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CgnP59242 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CgnP59242 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CgnP59242 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CgnP59242 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CgnP59242 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CgnP59242 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CgnP59242 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CgnP59242 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CgnP59242 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CgnP59242 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CgnP59242 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CgnP59242 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CgnP59242 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CgnP59242 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CgnP59242 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms