Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Epb41P48193 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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