Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab11bP46638 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab11bP46638 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab11bP46638 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab11bP46638 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab11bP46638 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rab11bP46638 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rab11bP46638 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rab11bP46638 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Rab11bP46638 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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