Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Apoc1P34928 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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