Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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