Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms