Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms