Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18532 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18532 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18532 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms