Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18530 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18530 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18530 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms