Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gabra6P16305 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms