Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl4P14097 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl4P14097 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms