Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04224 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04224 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04224 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms