Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sec22bO08547 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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