Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms