Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp72F8VQC1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms