Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms