Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Myo5cE9Q1F5 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Myo5cE9Q1F5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo5cE9Q1F5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms