Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms