Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms