Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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