Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms