Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H60cB1B213 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms