Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprfA2A8L5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms