Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm3839S4R1W1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm3839S4R1W1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm3839S4R1W1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3839S4R1W1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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