Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TapbpQ9R233 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms