Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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