Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mrpl39Q9JKF7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl39Q9JKF7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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