Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms