Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Pop5Q9DB28 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Pop5Q9DB28 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Pop5Q9DB28 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms