Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Med11Q9D8C6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Med11Q9D8C6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Med11Q9D8C6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Med11Q9D8C6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Med11Q9D8C6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Med11Q9D8C6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Med11Q9D8C6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Med11Q9D8C6 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med11Q9D8C6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms