Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lonrf3Q9D4H7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lonrf3Q9D4H7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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