Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed11Q9D2R4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms