Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pkp2Q9CQ73 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms