Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ubqln4Q99NB8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubqln4Q99NB8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms