Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed9Q99KF1 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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