Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms