Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Csmd1Q923L3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Csmd1Q923L3 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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