Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms