Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Znf628Q8CJ78 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms